Что касается толщины линий крестов сетки, как слоя, можем попросить коллег, но по срокам тут мы ничего не можем ответить, когда они это сделают. Они версии TopoL не выпускают часто, возможно, придётся подождать.

Что касается сетки, как точечных объектов, то тут проблем, я считаю, нет. Вы считаете, что это не очень удобно, ну, уже извините, я существенной разницы не вижу.

Что касается видимости слоёв, TopoL по умолчанию выстраивает их так, что прорисовка начинается с полигонов и заканчивается текстами. Если Вы включите в правой части окна карты Легенду (можно, кажется, через контекстное меню окна), Вы сможете в ней установить любую другую последовательность прорисовки, но если Вы полигоны вытащите наверх, они соответственно всё под собой скроют. Тут никаких чудес - просто последовательность прорисовки слоёв программой.

Коллеги! Д.А. этим текстом дал исчерпывающий ответ относительно того, что мы можем сделать в части этого варианта решения вопроса.  Сделают партнеры - замечательно, не сделают - многократно повторяя преимущества решения этого вопроса именно таким образом, Вы никак не поможете и не ускорите возможную его реализацию.